水利工程系现开设水利类专业5个：水利工程、水利水电建筑工程、智慧水利技术、水利水电工程智能管理、治河与航道工程技术。水利工程为国家现代学徒制试点专业，全国水利高等职业院校A等级专业，山东省教育厅确定的“3+2”专本贯通分段培养试点专业（衔接山东农业大学水利水电工程本科专业）。水利工程、水利水电建筑工程、水利水电工程智能管理三个专业为全国水利优质专业、全国高职创新发展行动计划骨干专业、山东省品牌专业群建设专业、山东省高水平专业群建设专业。
交通类专业3个：道路与桥梁工程技术、高速铁路施工与维护、城市轨道交通工程技术。道路与桥梁工程技术专业是国家现代学徒制试点专业、山东省现代学徒制试点专业、全国优质水利高等职业院校重点建设专业、山东省首批技能型人才培养特色名校重点建设专业、山东省特色专业。
测绘地理信息类专业2个：工程测量技术、摄影测量与遥感技术（无人机摄影测量方向）。工程测量技术专业属我院传统优势专业，是省内最早开设工程测量技术专科层次培养的学校；随着无人机、云计算、大数据、高精度传感器等技术的不断成熟和应用拓展，我校在省内率先开设摄影测量与遥感技术专业，实行校企合作联合培养模式。
水利工程系师资力量雄厚，现有专兼职教师共126人，其中高级职称占72%，双师型教师占95%。享受国务院政府特殊津贴专家1人，入选水利部5151人才工程部级人选2人、山东省水利厅“3131人才培养工程”国内领先水平水利专家8人，拥有省级专业教学团队4个、水利职业教育教师教学创新团队2个，共取得国家级成果16项，省部级成果54项，市厅级成果32项。
现有国家水利协同创新中心1个，国家级节水灌溉生产性实训基地1个，省级技艺技能传承中心2个。拥有校内综合多功能实训室（场）40余个，已建成：现代智慧水利综合实训基地，包括水利工程综合枢纽仿真实训室、水利工程虚拟仿真实训中心、水利BIM协同创新实训中心、现代节水灌溉实训室、智慧水利安全监测实训室、山东水利安全生产教育基地VR体验馆等；现代交通工程综合实训基地，包括交通工程应用软件实训中心、交通无损检测实训室、路基路面实训场、桥梁实训场、隧道实训场、轨道实训场等；现代智能测绘综合实训基地，包括测绘典型地貌综合实训中心、数字摄影测量中心、测量教学练做一体化仿真实训室、测绘数据处理中心、智能精密监测实训场等。
学生在全国职业院校技能大赛、山东省职业院校技能大赛、全国水利职业院校技能大赛以及交通类、测绘类等技能大赛中获得一（特）等奖22项，二等奖38项，三等奖63项。在“互联网+”大学生创新创业大赛等创新创业大赛中获得一（特）等奖5项，二等奖8项，三等奖16项。有20余名学生被认定为山东省“齐鲁工匠后备人才”。
水利工程系与中国电建市政建设集团有限公司、中铁十四局集团有限公司、山东水总、水发集团、广州南方测绘科技有限公司、山东省地质测绘院等多家大型国有企业建立长期稳定产教融合合作关系，实行现代学徒制人才培养模式，不断完善校企合作育人机制，真正实现校企一体化育人，共同培育知识型、技能型、创新型高素质技术技能人才。近三年各专业就业率98%以上，专业对口就业率92%以上。
